Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM171Q8WVE6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms