Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCAF4Q8WV16 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms