Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRUNE2Q8WUY3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms