Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms