Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SPPL3Q8TCT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms