Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms