Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms