Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACE1Q8IYU2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms