Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUM7

NPAS4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS4Q8IUM7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS4Q8IUM7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS4Q8IUM7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms