Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC6Q7Z403 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms