Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms