Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP50Q70EL3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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