Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX2Q6XYB7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX2Q6XYB7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms