Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms