Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms