Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOBEC3HQ6NTF7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms