Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms