Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms