Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms