Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HABP4Q5JVS0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms