Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2BQ5JSZ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2BQ5JSZ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms