Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms