Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms