Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDCA8Q53HL2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms