Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms