Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms