Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC96Q2M329 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms