Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TNXAQ16473 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TNXAQ16473 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TNXAQ16473 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TNXAQ16473 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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TNXAQ16473 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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