Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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GABRA6Q16445 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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GABRA6Q16445 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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GABRA6Q16445 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GABRA6Q16445 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GABRA6Q16445 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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