Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA4Q16363 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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