Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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