Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1AQ15573 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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