Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF4Q15306 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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