Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD9Q14511 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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