Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms