Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOFQ13790 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOFQ13790 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOFQ13790 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOFQ13790 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOFQ13790 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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