Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B2Q13435 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B2Q13435 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SF3B2Q13435 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SF3B2Q13435 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SF3B2Q13435 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SF3B2Q13435 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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