Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP4Q13115 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP4Q13115 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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