Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGXB3Q12766 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HMGXB3Q12766 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms