Protein–RNA interactions for Protein: Q12301

YDL180W, Uncharacterized membrane protein YDL180W, yeastyeast

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL180WQ12301 FIN1YDR130C 876 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SPT15YER148W 723 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PEX14YGL153W 1026 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YGR149WYGR149W 1299 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 CPR7YJR032W 1182 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 EMC2YJR088C 879 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 REC102YLR329W 795 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RPL20AYMR242C 519 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 ATP11YNL315C 957 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YPR027CYPR027C 834 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YPP1YGR198W 2454 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 TPO5YKL174C 1857 nt2.33□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YKR015CYKR015C 1707 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YCL076WYCL076W 744 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RPS22AYJL190C 393 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RSM26YJR101W 801 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YAR075WYAR075W 474 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YPR203WYPR203W 309 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PFF1YBR074W 2931 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 CBP2YHL038C 1893 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 MNT3YIL014W 1893 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 STE24YJR117W 1362 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RPO41YFL036W 4056 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 CHS3YBR023C 3498 nt2.32□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 MSS4YDR208W 2340 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 BUB1YGR188C 3066 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 MSS2YDL107W 1056 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YGR039WYGR039W 312 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YIL174WYIL174W 228 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 TDA8YAL064C-A 381 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YLR444CYLR444C 303 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SYC1YOR179C 567 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 MET6YER091C 2304 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SRP68YPL243W 1800 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YOR365CYOR365C 2112 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PSY2YNL201C 2577 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YDR250CYDR250C 276 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 IRC6YFR043C 714 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 CIR1YGR207C 786 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YNL203CYNL203C 612 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 snR11snR11 258 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RFM1YOR279C 933 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 ITT1YML068W 1395 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 ACA1YER045C 1470 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 MED1YPR070W 1701 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 JSN1YJR091C 3276 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 NAB6YML117W 3405 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 AXL1YPR122W 3627 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SAP1YER047C 2694 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 GYL1YMR192W 2163 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PST1YDR055W 1335 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 HPA3YEL066W 540 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RNR2YJL026W 1200 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YJR020WYJR020W 333 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 INP1YMR204C 1263 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RPL23AYBL087C 414 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 MPD2YOL088C 834 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SPS4YOR313C 1017 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 ESC1YMR219W 4977 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SGS1YMR190C 4344 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 KIN82YCR091W 2163 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SKT5YBL061C 2091 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 DSE4YNR067C 3354 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PDR3YBL005W 2931 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 AI2Q0055 2565 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YJL132WYJL132W 2253 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PSK1YAL017W 4071 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YDL050CYDL050C 372 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PMI40YER003C 1290 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 DUO1YGL061C 744 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 RCE1YMR274C 948 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YMR310CYMR310C 954 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YBL094CYBL094C 333 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 PFK27YOL136C 1194 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 YOR062CYOR062C 807 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 CAF20YOR276W 486 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SUR1YPL057C 1149 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 SEC26YDR238C 2922 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 HUL5YGL141W 2733 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL180WQ12301 AYT1YLL063C 1425 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 DSS1YMR287C 2910 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 YGL101WYGL101W 648 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 SAW1YAL027W 786 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 YKL066WYKL066W 444 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 YLR076CYLR076C 423 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 VPS28YPL065W 729 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 YCK2YNL154C 1641 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL180WQ12301 NAB3YPL190C 2409 nt2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms