Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms