Protein–RNA interactions for Protein: Q08116

RGS1, Regulator of G-protein signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS1Q08116 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGS1Q08116 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGS1Q08116 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms