Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL16A1Q07092 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms