Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX8Q06710 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms