Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG1Q06432 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms