Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 YPL109CYPL109C 1974 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 SIP1YDR422C 2448 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 KIN3YAR018C 1308 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 SUC2YIL162W 1599 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 YDL228CYDL228C 642 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 YGR018CYGR018C 330 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 PXR1YGR280C 816 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 SNX4YJL036W 1272 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 YAR075WYAR075W 474 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 KEX1YGL203C 2190 nt4.54□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 SAT4YCR008W 1812 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 RRN7YJL025W 1545 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 CDC6YJL194W 1542 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 STB2YMR053C 2553 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 YDL032WYDL032W 312 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 RCR2YDR003W 633 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 DPB4YDR121W 591 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 MAK16YAL025C 921 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 RPC37YKR025W 849 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 OPY2YPR075C 1083 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 AFR1YDR085C 1863 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 MLH2YLR035C 2088 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 VPS33YLR396C 2076 nt4.53□□□□□ -1.68
HRQ1Q05549 FAR8YMR029C 1572 nt4.53□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YJL049WYJL049W 1353 nt4.53□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 MON1YGL124C 1935 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 SNT1YCR033W 3681 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 GLC7YER133W 939 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 SEC4YFL005W 648 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 SOP4YJL192C 705 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YJR011CYJR011C 786 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YJR038CYJR038C 363 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 IRC19YLL033W 693 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 IMP1YMR150C 573 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YNL058CYNL058C 951 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 MSN1YOL116W 1149 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 WHI3YNL197C 1986 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 KIN2YLR096W 3444 nt4.52□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YBP2YGL060W 1926 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YDL187CYDL187C 330 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YHR130CYHR130C 336 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 RSM25YIL093C 795 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YAL065CYAL065C 387 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YNL235CYNL235C 432 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 PHO80YOL001W 882 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YOR029WYOR029W 336 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 PIN3YPR154W 648 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 APD1YBR151W 951 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ANR2YKL047W 1551 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ACK1YDL203C 1872 nt4.51□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ARP4YJL081C 1470 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YJR037WYJR037W 384 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 NNF1YJR112W 606 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YRA2YKL214C 612 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YML053CYML053C 639 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ATP18YML081C-A 180 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YMR087WYMR087W 855 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YNL057WYNL057W 333 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YPL088WYPL088W 1029 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 SUS1YBR111W-A 291 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 PHR1YOR386W 1698 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ECM16YMR128W 3804 nt4.5□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ARP5YNL059C 2268 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 GAC1YOR178C 2382 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 DBP3YGL078C 1572 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 PPZ1YML016C 2079 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 VMA8YEL051W 771 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 FUR1YHR128W 651 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 CFD1YIL003W 882 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 HIS5YIL116W 1158 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 TFB2YPL122C 1542 nt4.49□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 NEL1YHR035W 1893 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 TMA17YDL110C 453 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ECM11YDR446W 909 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 PUG1YER185W 912 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YGR269WYGR269W 327 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 RPI1YIL119C 1224 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YLR171WYLR171W 390 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 BER1YLR412W 825 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 GLN4YOR168W 2430 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 PUT2YHR037W 1728 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ERG11YHR007C 1593 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 SYF1YDR416W 2580 nt4.48□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 DSN1YIR010W 1731 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YER034WYER034W 558 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 IES5YER092W 378 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YGL108CYGL108C 423 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 COX2Q0250 756 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 SDL1YIL167W 633 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 ASG7YJL170C 630 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 PIR1YKL164C 1026 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 RDN58-1RDN58-1 158 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 RDN58-2RDN58-2 158 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 SWS2YNL081C 432 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 RHO5YNL180C 996 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YNR021WYNR021W 1215 nt4.47□□□□□ -1.69
HRQ1Q05549 YOR186WYOR186W 435 nt4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms