Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms