Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A3Q01959 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms