Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HBBP68871 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HBBP68871 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HBBP68871 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HBBP68871 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HBBP68871 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HBBP68871 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HBBP68871 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms