Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RPS29P62273 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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